يمارس مدير المركز الصلاحيات الآتية:

أولاً: إدارة شؤون المركز من النواحي العلمية والمالية والإدارية.

ثانياً: تمثيل المركز في الأنشطة داخل العراق وخارجه التي يتطلبها عمل المركز.

ثالثاً: تنفيذ قرارات مجلس المركز.

رابعاً: التوصية باختيار العاملين في المركز أو الوحدة.

خامساً: الموافقة على نشر البحوث المنجزة.

سادساً: إعداد مشروع الموازنة السنوية للمركز أو الوحدة وإعداد ملاكه وحساباته الختامية.

سابعاً: منح المكافآت التشجيعية للعاملين وفق الصلاحيات المحددة له.

ثامناً: الموافقة على اشتراك منتسبي المركز في الأنشطة المختلفة داخل العراق.

تاسعاً: ترشيح منتسبي المركز أو الوحدة للدراسات العليا داخل العراق وخارجه.

عاشراً: اقتراح استحداث أو دمج أو إلغاء تشكيلات المركز أو الوحدة.

حادي عشر: التوصية بمنح الإجازات الدراسية داخل العراق وخارجه.

ثاني عشر: الموافقة على شراء واستيراد الوسائل المختبرية والمستلزمات الأخرى والمجلات والكتب وفقاً للتعليمات والضوابط السارية.